실시간 PCR을 활용한 RNA 발현 해석을 실시할 수 있어, 비용을 종래의 1/4 정도로 억제한다

이 과제를 해소하기 위해 연구를 계속하고 있던 K씨는, 어느 회의에서 동양방의 「QuantAccuracy ^® , RT-RamDA ^TM cDNA Synthesis Kit」를 사용한 싱글셀 해석의 보고를 청강할 기회를 얻습니다. 이 키트는 RT-RamDA ^TM 법을 채용하고 있어 이화학연구소의 지도하에 동양방에서 개발한 제품이었습니다.

흥미를 끌었던 K씨는 조속히, 동양방에 문의해, 이 킷에 대해 자세한 이야기를 듣기로 했습니다.

"여러가지 질문을 해달라고, 이 시약 키트라면 미량의 RNA에서도 실시간 PCR법을 이용한 RNA 발현 해석이 가능한 cDNA를 조제할 수 있는 것을 알았습니다. 그것을 듣고 어쩌면 우리가 직면 하고 있던 과제에 매치한 것이 아닐까, 기대가 부풀어졌습니다」(K씨)

한층 더 이야기를 들어보면, 이 키트는 싱글 셀로부터의 검출 누설(바이어스)이 적고, cDNA의 조제가 가능하다는 것을 알았습니다. 또한 cDNA의 증폭능이 있고, 증폭능이 없는 키트와 비교하면 20배 이상의 양의 cDNA를 얻을 수 있었습니다.

「해석에 관한 퍼포먼스에 뛰어나고 있을 뿐만 아니라, 1회당의 비용에 관해서도, cDNA 증폭능이 있는 타사 제품과 비교하면 1/4 정도로 끝난다는 것을 알았습니다」(K씨)

분자생물학연구실에서는 곧바로 동양방으로부터 「QuantAccuracy ^® , RT-RamDA ^TM cDNA Synthesis Kit」의 샘플을 제공받아 평가를 실시해 보았습니다. 그러면 지금까지 시도해 온 다른 시약 키트에서는 RNA량이 적으면 cDNA 합성이 어려웠습니다만, 이번 샘플에서는 훌륭하게 cDNA 합성에 성공할 수 있었습니다.

대학에서는 「QuantAccuracy ^® , RT-RamDA ^TM cDNA Synthesis Kit」의 계속 채용을 결정. 이 키트에서 조제한 cDNA로부터 실시간 PCR에 의한 해석을 도입함으로써 scRNA-Seq를 보완하는 데이터를 취득할 수 있게 되어, 비용 절감, 또한 NGS와 scRNA-seq와 조합함으로써 효율 적인 실험이 가능해졌습니다.

RT-RamDA ^TM 는 국립 R&D 법인 이화학 연구소의 상표입니다. *QuantAccuracy ^® 는 도요보 주식회사의 등록상표입니다.