배경

연일 많은 검체가 반입되어 분석, 해석에 해당하는 N사. 검체는 이전부터 비교해 다방면에 걸치게 되어, 검출이나 부수하는 작업에 시간이 걸리고 있었다. 고객으로부터는, 이 곳의 해석 보고의 늦음을 지적되는 것이 늘어나고, 시급한 개선이 필요했다.

도전

늘어나는 분석, 해석 의뢰를 빨리 완료해 생산성을 올리고 싶지만, 중요한 효소가…

연일 많은 검체가 반입되어 분석, 해석에 해당하는 N사. 검체는 이전부터 비교해 다방면에 걸치게 되어, 검출이나 부수하는 작업에 시간이 걸리고 있었다. 고객으로부터는, 이 곳의 해석 보고의 늦음을 지적되는 것이 늘어나고, 시급한 개선이 필요했다.

늘어나는 분석, 해석 의뢰를 빨리 완료해 생산성을 올리고 싶지만, 중요한 효소가…

시작으로 개선을 위해, RNA 발현 해석 그룹에서는 1 시료 당 해석 시간을 계측하고, 시간 단축을 도모할 수 있는 공정을 찾아내고, 개선책을 탐구하기로 했습니다.

RNA 발현 해석 그룹의 담당 연구원 F씨는 이 때의 상황을 다음과 같이 말합니다.
1번의 요인은 RNA의 검출에 시간이 걸리고 있는 것이었습니다. 검체가 미량인 경우에는 증폭에 시간이 걸렸고, 증폭이 약한 경우에는 처음부터 다시 해야 합니다. 그래서 상당한 시간을 받고 있었습니다. 더 검출의 감도를 올리지 않으면…

F씨처럼 많은 경우에 사용하고 있는 역전사 반응용 효소는 37℃~42℃ 정도입니다. 따라서 GC가 풍부한 타겟이나 고차 구조를 취하기 쉬운 타겟의 경우 증폭이 매우 어려웠습니다.
그 밖에도, cDNA 합성을 실시한 후, 리얼타임 PCR의 반응액에 다시 넣을 필요가 있어, 여기에서도 시간과 수고가 걸리고 있었습니다.

F씨는 이러한 상황을 종합적으로 분석해 보았고, 개선의 실마리는 효소에 있다고 생각했습니다.
그런데, 지금까지의 경험이나 지견이 있는 효소를 여러가지 시험해 보았습니다만, 결과는 모두 동일해, 큰 개선은 전망할 수 없고, F씨는 곤란해 버렸습니다.