배경

원스텝법의 리얼타임 RT-PCR로 RNA의 검출·정량을 연일 실시하고 있는 J대학 의학부 분자 생물학 연구실. 다양한 종류의 바이러스의 검출과 정량이 많아, 복수의 연구원이 대응에 임하고 있었지만, 이 방법에 있는 과제를 안고 있었다.

도전

처리 데이터의 정밀도에 불안이 생겨 검출·정량의 사전 검토에 시간이 걸려 버린다…

원스텝법의 리얼타임 RT-PCR로 RNA의 검출·정량을 연일 실시하고 있는 J대학 의학부 분자 생물학 연구실. 다양한 종류의 바이러스의 검출과 정량이 많아, 복수의 연구원이 대응에 임하고 있었지만, 이 방법에 있는 과제를 안고 있었다.

처리 데이터의 정밀도에 불안이 생겨, 검출·정량의 사전 검토에 시간이 걸려 버린다…

J대학 의학부 분자 생물학 연구실에서는 원스텝법의 실시간 RT-PCR로 RNA의 검출·정량을 연일 실시하고 있습니다만, 사용하고 있는 시약 키트에 있어서, 몇 가지 해결해야 할 과제가 있었습니다.

연구팀의 K씨는 다음과 같이 되돌아 본다.
"프라이머를 설계하는 영역이 한정되어 증폭에 편향이 나오는 것으로, 프라이머의 최적화가 어렵다고 하는 과제를 안고 있었습니다. 증폭 영역의 결정 방법에 따라서는 결과에 편차가 많아, 처리 데이터의 정밀도에 불안 가 생겨, 프라이머의 설계로부터 다시 하는 일도 있었습니다. 그 결과, 사전 검토에 시간이 걸리고, 좀처럼 실험이 진행되지 않았습니다.」

연구실에서는 과제의 개선을 위해, 타 메이커의 원스텝법의 시약 킷을 사용해 보기로 했습니다. 그런데, RNA 바이러스나 발현량이 적은 mRNA의 검출·정량을 할 수 없는, 30 카피 이하의 바이러스 RNA에서는 검출·정량이 불가능 등, 키트에 의해 대응 가능한 바이러스의 종류에 편차가 있는 것을 알았습니다.
"어떤 시약 키트가 어떤 바이러스에 가장 적합한지 정보를 정리하기로 결정했습니다. 해버려… "(K씨)

큰 개선이 보이지 않는 채, 연구실에서는 오늘날에도 많은 샘플 해석 작업이 계속되고 있습니다.