배경

게놈 의료 연구에 주력하는 P 대학 의료 연구 센터. 같은 테마를 연구하고 있는 다른 대학이 발표하는 논문의 양과 질 수준이 급상승해 화제가 되고 있었다. 이유를 조사한 결과, 해석이 힘든 싱글 셀을 적극적으로 도입한 것을 알 수 있었다.

도전

질 높은 논문의 랭킹에 있어서의 약진의 이유인 싱글 셀 해석, 스스로도 사용해 보고 싶지만…

게놈 의료 연구에 주력하는 P 대학 의료 연구 센터. 같은 테마를 연구하고 있는 다른 대학이 발표하는 논문의 양과 질 수준이 급상승해 화제가 되고 있었다. 이유를 조사한 결과, 해석이 힘든 싱글 셀을 적극적으로 도입한 것을 알 수 있었다.

질 높은 논문의 랭킹에 있어서의 약진의 이유인 싱글 셀 해석, 스스로도 사용해 보고 싶지만…

단일 셀 분석을 통해 RNA 수준에서 미세하게 분석할 수 있습니다. 그렇게 함으로써 예를 들어 지금까지 보이지 않았거나 몰랐던 유전자의 특성으로부터 새로운 발견이나 참신한 결과를 이 대학은 얻고 있었다.
의료연구센터의 연구원 H씨는 이 때의 상황을 다음과 같이 되돌아봅니다.
"상상 이상으로 고품질의 논문이 많았기 때문에, 종래의 수법에서는 간과하고 있던 새로운 결과를 얻을 수 있는 싱글 셀 해석의 수법에는 정말로 놀랐습니다. 거기서, 센터내에서도 싱글 셀 해석의 활용을 검토 했습니다. 그러나, 지식이 적은 일도 있어, 2개의 발을 밟은 상태였습니다」

조사한 결과, 싱글 셀 해석을 실시한다면 이화학 연구소(리켄)가 개발한 「RamDA-seq ^TM 」를 이용하는 것이 유효하다는 것을 H씨들은 밝혀냅니다. 그러나 이 방법은 시약 준비가 매우 어려웠습니다.

「다양한 문헌을 맞추면서, 시약의 조제 등, 어떻게든 준비를 해 해석에 임했습니다만, 몇번 해도 안정된 데이터를 얻기에는 이르지 않았습니다」(H씨)

「이대로는, 점점 차이가 붙어 버린다」라고, 이 상황에 P대학 의료 연구 센터는 초조했을 뿐이었습니다.