배경

매일 늦게까지 망라적 해석의 대응에 쫓기는 U대학 분자 생물학 연구실. 멀티플렉스 PCR을 활용하는 등, 지금까지도 해석 효율의 향상을 시도했지만, 성과는 모두 지금 하나. 해석 결과의 질의 문제도 부상해, 근본적인 개선책의 검토와 조기의 실행이 필요했다

도전

효율적으로 보이는 멀티플렉스 PCR. 그러나 그 뒤에서는 힘들고 번잡한 작업이…

매일 늦게까지 망라적 해석의 대응에 쫓기는 U대학 분자 생물학 연구실. 멀티플렉스 PCR을 활용하는 등, 지금까지도 해석 효율의 향상을 시도했지만, 성과는 모두 지금 하나. 해석 결과의 질의 문제도 부상해, 근본적인 개선책의 검토와 조기의 실행이 필요했다

효율적으로 보이는 멀티플렉스 PCR. 그러나 그 뒤에서는 힘들고 번잡한 작업이…

이번 문제는, 해석 의뢰가 많은 타겟 마다의 증폭에 수고와 시간이 걸려 버려, 해석 효율이 떨어지고 있었던 것이 주된 원인이었습니다. 이 보고를 연구원으로부터 들은 분자생물학연구실 담당 S교수는 현상을 이렇게 말합니다.
"확실히, 여러 영역의 DNA를 보기 위해서는, 타겟분의 PCR 튜브나 시약을 준비해야 합니다. 그래서, 실수에 의한 재분석 등도 빈발하고 있었습니다」

또, 멀티플렉스 PCR을 채용해도, 검체에 따라서는 다른 타겟, 영역에 PCR 시약의 성능을 좌우되어 버렸다는 것을 알았습니다. 증폭할 수 없는, 밴드가 불균일 등, 안정된 결과를 얻을 수 없는 채로, 프라이머를 재설계 다시 하는 등 많은 시간이 소비되고 있었습니다. 이러한 현상이 계속됨으로써, 해석 결과의 질의 저하가 우려되었습니다.

게다가, 멀티플렉스 PCR 이외에도, 드물게 후성유전자 분석의 의뢰가 퍼져, 전혀 다른 시약의 준비에, 불필요하게 시간이 걸리고 있었던 것도 알았습니다.

구체적인 해결책이 발견되지 않고, 이 현상에 곤란한 S 교수는, 날마다 많은 망라적 해석을 해내고 있는, 공공의 분석 센터에 근무하는 지인에게 상담을 받기로 했습니다.
곧 연락을 받고 발로 S 교수는 지인이 있는 분석 센터로 향했습니다.