준비 및 사양
성상 | 백색 무정형 분말, 동결건조 | |
---|---|---|
활동 | 1등급 5.0U/mg-solid 이상 | |
오염물질 | 류신 아미노펩티다제 | ≤1.0×10-1% |
트립신 유사 활성 | ≤1.0×10-1% |
속성
안정성 | −20℃에서 안정적 최소 1년 동안 (그림 1) |
---|---|
분자량 | 대략. 78,000 |
등전점 | 9.1 |
미카엘리스 상수 | 2.5×10-5M(Z-Gly-Pro-MCA) |
1.4 ×10-4M(Z-Gly-Pro-2NNap) | |
구조 | 모노머< /td> |
억제제 | DFP, 3, 4-디클로로이소쿠마린, Z-Gly-Pro-CH2Cl |
최적 pH | 6.5 (그림 2) |
최적 온도 | 37℃ (40℃) 2) (그림 3) |
pH 안정성 | 5.5−8.5(30℃,15시간)(그림 4) |
40℃ 미만 (pH7.0,10min) (그림 5) | |
기질 특이성 | < td>Y-Pro(Ala)-X(Y, 펩타이드 또는 N-보호된 아미노산; X, 아미노산,|
다양한 화학물질의 영향 | (표 2) |
응용 프로그램
이 효소는 펩타이드의 아미노산 서열을 결정하는 데 유용합니다. 및 프롤린 잔기를 함유한 단백질.
분석
원칙
p-니트로아닐린의 외관은 분광광도법으로 410nm에서 측정됩니다.
단위 정의
아래 설명된 조건에서 하나의 단위는 분당 1마이크로몰의 p-니트로아닐린을 형성합니다.
방법
시약
A. K-인산염 완충액, pH 7.0 | 0.1M |
---|---|
B. Z-Gly-Pro-pNA 용액 | 5mM[21.3mg의 Z-Gly-Pro-pNA(MW=426.43)를 약 8ml의 40% 디옥산에 60°C의 뜨거운 욕조에 녹입니다. 25°C로 식힌 후 40% 디옥산을 10ml까지 채웁니다](신선하게 준비해야 함) |
C. 아세트산 완충액, pH 4.0 | 10% TritonX-100을 함유한 1M 용액(5℃에 보관) |
D. 효소 희석제 | 50mM K-인산 완충액, pH 7.0 |
절차
1.시험관에 다음 반응 혼합물을 준비하고, 30℃에서 평형을 이루다 약 5분 동안.
1.0ml | K-인산염 완충액 | (A) | |
---|---|---|---|
0.25ml | 기질 용액 | (B) |
분석 혼합물의 농도 | tr>|||
---|---|---|---|
인산염 완충액 | 77.8 mM | ||
Z-Gly-Pro-pNA | 0.926mM |
Vt | : 총 용량(3.35ml) |
Vs | : 샘플 용량(0.1ml) | < /tr>
5.57 | : 분석 조건에서 p-니트로아닐린의 밀리몰 흡광 계수(cm2/micromole) |
1.0 | : 광선 길이(cm) |
t | : 반응 시간(5분) |
df | : 희석 인자 |
C | : 효소 농도 용해 상태(c mg/ml) |
참고자료< /h2>
1)T.Yoshimoto 및 D.Tsuru; Agric.Biol.Chem., 42, 2417 (1978)
2)T.Yoshimoto, R.Walter 및 D.Tsuru; J.Biol.Chem., 255, 4786(1980)
3)R.Walter; Biochim.Biophys.Acta.,422, 132(1976)
4)T.Yoshimoto, RCOlowski 및 R.Walter; Biochem.J., 16, 2942(1977)
5)T.Yoshimoto, M.Fischl, RCOlowski 및 R.Walter; J.Biol.Chem., 253, 3708 (1978)
6)T.Yoshimoto 및 D.Tsuru; 단백질, 핵산 및 효소(일본어), 29, 127(1984)
7)L.Haeffiner-Gormley, L.Parente 및 DBWetlaufer; Int.J.Peptide Protein Res., 26, 83 (1985)
8)T.Yoshimoto, K.Kawahara, F.Matsubara, K .Kado 및 D.Tsuru; J.Biochem., 98, 975 (1985)
표 1. 프롤린 특이적 엔도펩티다제의 기질 특이성
기판 | Km (mM) | kcat (s-1) | kcat/Km (mM-1・S-1) |
---|---|---|---|
↓ | |||
Pro-2NNap | < td>가수분해되지 않음 | ||
Z-Pro-2NNap | 가수분해되지 않음 | ||
Gly-Pro-2NNap | 가수분해되지 않음 | < td>||
Z-Gly-Pro-MCA | 0.025 | 115 | 4600 |
Z-Gly-Pro-2NNap | 0.14 | 169 | 1212 |
Z-Gly-Pro-pNP | 0.125 | 102 | 816 |
Z-Ala-Pro-2NNap | 0.08 | 642 | 834 |
ZD- Pro- 2NNap | 0.20 | 0.142 | 0.73 |
알라- | td> | ||
Z-Ala-Gly-Pro-2NNap | 0.29 | 192 | 664 |
ZD-Ala-Gly-Pro-2NNap | 0.14 | 38 td> | 271 |
Z-Gly-Pro-Leu | 0.22 | 23 | 104 |
Z-Gly-Pro-Phe | 0.74 | 180 | 250 |
Z-Gly-Pro-ALa | 0.39 | 240 | 620 | Z-Gly-Pro-D-Ala | 가수분해되지 않음 |
Z-Gly-Pro-Leu-Gly | 0.32 | 520 | 1600 |
Z- Gly-Pro-Leu-Ala | 0.42 | 520 | 1100 |
Z-Gly-Pro -Leu-D-Ala | 1.5 | 1600 | 1070 |
Z-Gly-Pro- Leu-Gly-Gly | 1.4 | 700 | 500 |
Z-Gly-Pro-Leu -Gly-Ala | 1.82 | 1000 | 550 |
Z, 카보벤족시; MCA, 4-메틸-쿠마릴-7-아미드; 2NNap, β-나프틸아미드; pNP, p-니트로페닐 에스테르.
표 2. Effect of Various Chemicals on Proline specific endopeptidase
[The enzyme dissolved in 50mM K-phosphate buffer, pH 7.0 (2.5U/ml) was incubated with each chemical at 23 30min.]
Chemical Concn.(mM) Residual< br>activity(%) None - 100 Metal salt 2.0 MgCl2 72.1 CaCl2 74.6 BaCl2 74.3 FeCl3 52.6 CoCl2 62.7 MnCl2< /sub> 68.9 ZnSO4 td> 56.8 Cd(OAc)2 31.9 NiCl2 66.8 CuSO 4 45.2 Pb(OAc)2< /td> 59.8 AgNO3 55.7 HgCl2 0 PCMB 2.0 71.9 MIA 2.0 78.1 Chemical Concn.(mM ) Residual
activity(%)NaF td> 2.0 76.9 NaN3 20.0 < td>77.3DFP 1.0 2.7 o- Phenanthroline 2.0 84.9 α,α′-Dipyridyl 1.0 84.9 Borate 50 73.4 IAA 2.0 62.8 NEM 2.0 74.4 Hydroxylamine 2.0 77.4 3,4 -Dichloroiso- coumarin 2.0 9.0 td> Triton X-100 0.10% 86.4 Brij 35< /td> 0.10% 84.8 Tween 20 0.10% 84.1< /td> Span 20 0.10% 81.9 Na-cholate< /td> 0.10% 84.1 SDS 0.05% 73.0 td>
Ac, CH3CO; PCMB, p-Chloromercuribenzoate; MIA, Monoiodoacetate; DFP , Diisopropylphosphorofluoridate; IAA, Iodoacetamide; NEM, N-Ethylmaleimide; SDS, Sodium dodecyl sulfate.
Fig.1. Stability (Powder form)
(kept under dry conditions)
Fig.2. pH-Activity
(30℃ in 50mM phosphate buffer)
>Fig.3. Temperature activity
(in 50mM phosphate buffer, pH 7.0)
Fig.4. pH-Stability< /p>
30℃, 15hr-treatment with buffer solution: pH4.5-7.0, 50mM acetate;pH6.0-8.5, 0.1M phosphate
< li>
Fig.5. Thermal stability
10min-treatment with 0.1M phosphate buffer, pH7.0 enzyme concn.:5U/ml
활성 측정법(Japanese)
1. 원리
p-Nitroaniline 생성량을 410nm에서의 흡광도 변화로 측정 .
2. 정의
하기 조건으로 1분간에 1마이크로몰의 p-Nitroaniline을 생성하는 효소량을 1단위(U )로 한다.
3. 시약
- 0.1M K-Phosphate 완충액, pH7.0
- 5mM Z-Gly-Pro-pNA 용액 [21.3mg의 Z-GlyPro-pNA (MW = 426.43)을 60 ℓ의 욕조에서 약 8ml의 40 % 디 옥산 증류수에 용해시킨다. 본 용해액을 25℃까지 냉각한 후, 40% 디옥산으로 10ml로 한다](용시 조제)
- 10% 트리톤 X-100을 포함하는 1M 아세트산 완충액, pH4.0< /li>
- 효소 희석액[50mM K-Phosphate 완충액, pH7.0]
효소 용액: 효소 표품을 미리 빙냉한 효소 희석 용액 (D)에 용해시키고 분석 직전에 동일한 완충액으로 0.05-0.2U / ml로 희석한다.
4. 절차
1. 시험관에 하기 반응 혼합물을 제조하고, 30℃ ;로 약 5분간 예비가온한다.
1.0 ml | K-Phosphate 완충액 | < td class="w20p">(A)|
0.25ml | 기질 용액 | (B) | < /tr>
2. 효소 용액 0.1ml를 첨가하여 반응을 개시한다.
3.30℃에서 정확하게 5분간 반응시킨 후, 아세트산완충액(C) 2.0ml를 첨가하여 반응을 정지 하자. 이 용액에 대해 410 nm에서의 흡광도를 측정한다 (ODtest).
4.맹검은 반응혼액①을 30℃으로 5분간 가온 후, 아세트산완충액(C)2.0 ㎖를 첨가하여 혼화시킨 후, 효소 용액 0.1㎖를 가하여 조제한다. 이 액에 대하여 이하 상기와 같이 흡광도를 측정한다(ODblank).
5. 수식
U/ml= p>
ΔOD(OD test-OD blank)×3.35(ml)×희석 배율
< p class="txt_14">5.57×1.0×5(분)×0.1
= Δ OD×1.20×희석 배율 | |
U/mg | = U/ml×1/C |
5.57 | : p-Nitroaniline의 밀리몰 분자 흡광 계수(cm2/micromole) |
1.0 | : 광로 길이(cm) |
C | : 용해 시 효소 농도(c mg/ml)< /td> |