가격표
KOD -Plus-
용도
●PCR
설명
KOD DNA polymerase를 기반으로 개발된 고정확도 PCR 효소입니다. 우리 PCR 효소 중 최고의 정확성을 보여줍니다. 본 효소는, 버퍼 조성의 개량이나 핫 스타트법의 채용에 의해, 종래품에 비해, 정확성, 및 PCR 성능이 현격히 향상하고 있습니다. KOD-Plus-Ver.2는 KOD-Plus-의 버퍼를 더욱 개선하여 PCR 성공률이 향상되었습니다.
특징
●뛰어난 정확성(당사 No.1)
KOD DNA polymerase의 특징인 최고 수준의 정확성을 더욱 향상시키고 Taq DNA polymerase의 약 80배의 정확성을 나타냅니다. DNA 클로닝에 이상적입니다.
● 핫 스타트로 PCR 성능 향상
2종류의 항KOD 항체를 효소에 혼합함으로써, 비특이 반응의 원인이 되는 상온하에서의 Polymerase 활성과 3'→5'Exonuclease 활성을 억제하고 있습니다. 항체는 PCR의 첫번째 변성 단계에서 비활성화되고 증폭 반응에는 영향을 미치지 않는다.
●신장성·증폭 효율 향상 반응 버퍼 조성을 지적화함으로써, 종래의 KOD DNA Polymerase보다 신장성·증폭 효율이 향상하고 있습니다.
● 우수한 내열성
Taq DNA polymerase보다 내열성이 우수하므로 변성 단계의 온도를 높게 설정할 수 있으며 GC가 풍부한 고차 구조를 형성하는 타겟에 효과적입니다.
● 높은 PCR 성공률 「KOD -Plus-Ver.2」[Code No. KOD-211]
증폭하기 어려운 타겟이나 긴 타겟에 대한 PCR 성공률이 KOD -Plus-보다 향상되었습니다. 또, 역전사 반응액의 반입에 의한 저해도 저감되고 있습니다.
원리
실시예
1. GC 리치 타겟의 증폭 비교
GC 함량 약 70%의 Pseudomonas의 리파아제 유전자를 포함하는 플라스미드를 주형에 약 2kb를 타겟으로 하여 PCR을 실시하고, rTaq DNA Polymerase와 증폭도의 비교를 실시했습니다. 사이클은 연장 온도를 제외하고는 동일한 조건에서 수행되었다. 그 결과, KOD-Plus-에서는 통상의 조건에서 강한 증폭을 확인할 수 있었지만, rTaq DNA Polymerase에서는 5% DMSO 또는 A사 PCR 인핸서를 첨가한 조건에서만 증폭을 확인할 수 있다. 네.
2. 타사 고정확성 PCR 효소와의 PCR 증폭 성능 비교
Human β-globin 유전자 0.6~3.6kb를 타겟으로 하여 KOD-Plus- 및 타사 고정확성 PCR 효소를 이용하여 증폭하여 비교를 실시했습니다. 그 결과, KOD-Plus-는 타사 High Fidelity 효소에 비해 양호한 증폭을 나타냈다.
3. 각종 cDNA를 타깃으로 한 타사 PCR용 효소와의 증폭 성능의 비교
HeLa total RNA로부터 역전사한 cDNA를 주형으로 하여, 4종류의 타겟에 대해 PCR 효율의 비교를 실시했습니다.
그 결과, KOD-Plus-Ver.2는 다른 효소에 비해 양호한 증폭을 보였다. 특히 증폭이 어려운 6.8kb의 타겟에서도 명확한 증폭이 보였습니다.
실시예 4: inverse PCR에 의한 부위 특이적 변이 도입
실시예 5: 다양한 주형을 이용한 Long PCR
실시 예 6 : Colony direct-PCR에 의한 스타필로코커스 아우레우스의 유전자 프로파일 분석
실시예 7: Colony direct-PCR에 의한 각종 미생물 유전자의 간편·신속 검출
실시 예 8 : 헤파린 함유 샘플을 사용한 PCR에서 베타 인 첨가 효과
기타 실시예
참고 문헌
1) J. Mo et al., J. Mol. Biol ., 222 : 925-936(1991)
2) M. Takagi et al., Appl. Environ. Microbiol. , 63 : 4504-4510(1997)
3) H. Hashimoto et al., J. Biochem. (Tokyo), 125 : 983-986 (1999)
4) H. Mizuguchi et al., J. Biochem. (Tokyo), 126 : 762-768 (1999)
5) H. Hashimoto et al., J. Mol. Biol. , 306 : 469-477(2001)
6) M. Watanabe et al., J. Biochem . (Tokyo), 131 : 183-191 (2002)
7) H. Terasaki et al., Intl. J. Mol. Med. , 9: 107-112(2002)
제품 내용
【KOD-201】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-2B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개
【KOD-211】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-3B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개
*KOD 항체를 1.6μg/μL의 농도로 포함하고 있습니다.모양:
50mM Tris-HCl(pH8.0)
0.1mM EDTA
1mM DTT 0.001% Tween ® 20
0.001% Nonidet ® P-40
50% Glycerol
활동 정의 :
75℃에 있어서, 30분간에 10nmol의 전체 뉴클레오티드를 산 불용성 분획에 도입하는 효소량을 1U로 합니다.
순도 본 효소 15U와 pBR322 1㎍을 75℃에서 4시간 반응시켜도 전기영동 패턴은 변화하지 않는 것을 확인하고 있습니다.
기원:
E.coli 재조합체
- 주의사항
PCR에는 제품에 첨부되어 있는 dNTPs 또는 별매의 dNTPs Mixture (2mM) [NTP-201]을 사용해 주십시오. 다른 dNTPs에서는 충분한 성능을 얻지 못할 수 있습니다.
- 기본 반응 조건
10×PCR Buffer(KOD -Plus-용) 5μL
25mM MgSO 4 2μL (1mM)
각 Primer 15pmol each 2mM
dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genomic DNA)
~1μL(역전사 반응액)*
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL
※원포인트 어드바이스의 RT 반응액을 샘플로 하는 경우, 를 확인해 주십시오.
<3단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
94℃, 15sec.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles
<2단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
94℃, 15sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles
10×PCR Buffer(KOD -Plus- Ver.2용) 5μL
25mM MgSO 4 3μL (1.5mM)
각 Primer 15pmol each
2mM dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genome DNA)
~2μL(역전사 반응액)
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL
<3단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
98 ℃, 10 초.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles
<2단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
98 ℃, 10 초.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles
* 일반적으로 3단계 사이클을 수행합니다.
Tm값이 72℃ 이상의 프라이머를 이용하여 3스텝 사이클에서 스미어가 인정된 경우, 2스텝 사이클을 하면 스미어가 해소되는 경우가 있습니다.
※ 프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다.
- 비고
※10×PCR Buffer는 본 효소 전용입니다. KOD DNA Polymerase의 Buffer와는 조성이 다릅니다.
- 원포인트 조언
●PCR 산물의 클로닝 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있어, 평활 말단 클로닝법에 의해 클로닝할 수 있습니다.
그 때 벡터측을 탈인산화 처리하고 있는 경우, PCR 산물의 인산화를 실시하거나, 5'인산기가 붙은 프라이머를 사용할 필요가 있습니다.
또한, 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있기 때문에 직접 TA 클로닝할 수 없습니다. 전용 TA 클로닝 키트 "TArget Clone TM -Plus-"를 사용하십시오.
● PCR 조건의 설정에 대해서 효소의 표준 사용량은 50μL의 계에 대해 1U로 해 주십시오. 신장 반응은 68℃에서 실시하고 타겟 1kb에 대해 1min.을 표준으로 합니다.
스메어링이 일어나고 있는 경우는 MgSO 4 의 농도를 낮추고, 증폭이 보이지 않는 경우는 MgSO 4 농도를 올려 검토한다.
●GC 리치인 주형의 경우 반응액에 DMSO를 최종 농도 2~5% 정도 첨가함으로써 개선되는 경우가 있습니다.
●RT 반응액을 주형으로 하는 경우
RT 반응액의 대량의 반입은 본 효소에 의한 PCR 반응을 저해하는 경우가 있습니다. RT반응액의 PCR로의 반입은 PCR반응액의 1/25이하(바람직하게는 1/50이하)를 추천합니다. 이 경우, RT 반응액으로부터의 Mg2+나 dNTPs의 반입에 대해서는 고려할 필요는 없고, 기본 반응 조건에 따라, 본 효소의 첨부의 dNTPs와 MgSO4를 첨가해 주시면 문제 없습니다.
●프라이머의 설계 3'측에 미스매치가 있는 프라이머는, 본 효소에 의해 교정을 받는 경우가 있습니다.
※ 프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다. 이노신을 포함하는 프라이머의 Tm 값은 이 방법으로 계산할 수 없습니다.
●DNA 말단 평활화에 이용하는 경우는 이쪽을 봐 주세요.
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KOD -Plus- [KOD-201] 부품 단품
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KOD -Plus-[KOD-201], KOD -Plus Ver.2[KOD-211], <br>KOD -Plus- Neo[KOD-401]파트 단품
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dATP, dGTP, dCTP, dTTP 혼합 용액
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평활 말단 PCR 산물에 dA 첨가
품명 | Code No. | 포장 | 저장 온도 | 설명서 사양 | SDS | 법규제 ※ |
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품명 10×A-attachment Mix | Code No.TAK-301 | 포장 25μL(25회용) | 저장 온도 | 설명서 사양 | SDS | 법규제 ※ -20℃ |
제품 내용
【KOD-201】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-2B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개
【KOD-211】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-3B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개
*KOD 항체를 1.6μg/μL의 농도로 포함하고 있습니다.모양:
50mM Tris-HCl(pH8.0)
0.1mM EDTA
1mM DTT 0.001% Tween ® 20
0.001% Nonidet ® P-40
50% Glycerol
활동 정의 :
75℃에 있어서, 30분간에 10nmol의 전체 뉴클레오티드를 산 불용성 분획에 도입하는 효소량을 1U로 합니다.
순도 본 효소 15U와 pBR322 1㎍을 75℃에서 4시간 반응시켜도 전기영동 패턴은 변화하지 않는 것을 확인하고 있습니다.
기원:
E.coli 재조합체
- 주의사항
PCR에는 제품에 첨부되어 있는 dNTPs 또는 별매의 dNTPs Mixture (2mM) [NTP-201]을 사용해 주십시오. 다른 dNTPs에서는 충분한 성능을 얻지 못할 수 있습니다.
- 기본 반응 조건
10×PCR Buffer(KOD -Plus-용) 5μL
25mM MgSO 4 2μL (1mM)
각 Primer 15pmol each 2mM
dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genomic DNA)
~1μL(역전사 반응액)*
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL
※원포인트 어드바이스의 RT 반응액을 샘플로 하는 경우, 를 확인해 주십시오.
<3단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
94℃, 15sec.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles
<2단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
94℃, 15sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles
10×PCR Buffer(KOD -Plus- Ver.2용) 5μL
25mM MgSO 4 3μL (1.5mM)
각 Primer 15pmol each
2mM dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genome DNA)
~2μL(역전사 반응액)
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL
<3단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
98 ℃, 10 초.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles
<2단계 사이클> *
94℃, 2min.
↓
98 ℃, 10 초.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles
* 일반적으로 3단계 사이클을 수행합니다.
Tm값이 72℃ 이상의 프라이머를 이용하여 3스텝 사이클에서 스미어가 인정된 경우, 2스텝 사이클을 하면 스미어가 해소되는 경우가 있습니다.
※ 프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다.
- 비고
※10×PCR Buffer는 본 효소 전용입니다. KOD DNA Polymerase의 Buffer와는 조성이 다릅니다.
- 원포인트 조언
●PCR 산물의 클로닝 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있어, 평활 말단 클로닝법에 의해 클로닝할 수 있습니다.
그 때 벡터측을 탈인산화 처리하고 있는 경우, PCR 산물의 인산화를 실시하거나, 5'인산기가 붙은 프라이머를 사용할 필요가 있습니다.
또한, 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있기 때문에 직접 TA 클로닝할 수 없습니다. 전용 TA 클로닝 키트 "TArget Clone TM -Plus-"를 사용하십시오.
● PCR 조건의 설정에 대해서 효소의 표준 사용량은 50μL의 계에 대해 1U로 해 주십시오. 신장 반응은 68℃에서 실시하고 타겟 1kb에 대해 1min.을 표준으로 합니다.
스메어링이 일어나고 있는 경우는 MgSO 4 의 농도를 낮추고, 증폭이 보이지 않는 경우는 MgSO 4 농도를 올려 검토한다.
●GC 리치인 주형의 경우 반응액에 DMSO를 최종 농도 2~5% 정도 첨가함으로써 개선되는 경우가 있습니다.
●RT 반응액을 주형으로 하는 경우
RT 반응액의 대량의 반입은 본 효소에 의한 PCR 반응을 저해하는 경우가 있습니다. RT반응액의 PCR로의 반입은 PCR반응액의 1/25이하(바람직하게는 1/50이하)를 추천합니다. 이 경우, RT 반응액으로부터의 Mg2+나 dNTPs의 반입에 대해서는 고려할 필요는 없고, 기본 반응 조건에 따라, 본 효소의 첨부의 dNTPs와 MgSO4를 첨가해 주시면 문제 없습니다.
●프라이머의 설계 3'측에 미스매치가 있는 프라이머는, 본 효소에 의해 교정을 받는 경우가 있습니다.
※ 프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다. 이노신을 포함하는 프라이머의 Tm 값은 이 방법으로 계산할 수 없습니다.
●DNA 말단 평활화에 이용하는 경우는 이쪽을 봐 주세요.
※ 법규제에 대해서
독독물 및 극물 단속법 [의약용 외독물]
극독물 및 극물 단속법 [의약용 외극물]
위험소방법[위험물]
신구입시에 신청서의 제출이 필요한 제품
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국가국민보호법[독소]
세트카르타헤나 법 (유전자 재조합 생물 등의 사용 등의 규제에 의한
생물의 다양성 확보에 관한 법률)
PPRTR법(화학물질 배출 파악 관리 촉진법) [신고 의무 물질]
노동노동안전보건법[통지 또는 표시의무물질]