PCR [Fidelity], [High efficient]

KOD-Plus-/KOD-Plus- Ver.2 [KOD-201]

가격표

KOD -Plus-

Code No. 포장 저장 온도 설명서 사양 SDS 법규제
Code No.KOD-201 포장 200U×1개 저장 온도 -20℃ 설명서 사양 SDS 법규제 없음
Code No.KOD-201X5 포장 (200U×1개)×5 저장 온도 -20℃ 설명서 사양 SDS 법규제 없음
Code No.KOD-201X10 포장 (200U×1개)×10 저장 온도 -20℃ 설명서 사양 SDS 법규제 없음

KOD -Plus- Ver.2

Code No. 포장 저장 온도 설명서 사양 SDS 법규제
Code No.KOD-211 포장 200U×1개 저장 온도 -20℃ 설명서 사양 SDS 법규제 없음
Code No.KOD-211X5 포장 (200U×1개)×5 저장 온도 -20℃ 설명서 사양 SDS 법규제 없음

용도

●PCR

설명

KOD DNA polymerase를 기반으로 개발된 고정확도 PCR 효소입니다. 우리 PCR 효소 중 최고의 정확성을 보여줍니다. 본 효소는, 버퍼 조성의 개량이나 핫 스타트법의 채용에 의해, 종래품에 비해, 정확성, 및 PCR 성능이 현격히 향상하고 있습니다. KOD-Plus-Ver.2는 KOD-Plus-의 버퍼를 더욱 개선하여 PCR 성공률이 향상되었습니다.

특징

●뛰어난 정확성(당사 No.1)
KOD DNA polymerase의 특징인 최고 수준의 정확성을 더욱 향상시키고 Taq DNA polymerase의 약 80배의 정확성을 나타냅니다. DNA 클로닝에 이상적입니다.



● 핫 스타트로 PCR 성능 향상
2종류의 항KOD 항체를 효소에 혼합함으로써, 비특이 반응의 원인이 되는 상온하에서의 Polymerase 활성과 3'→5'Exonuclease 활성을 억제하고 있습니다. 항체는 PCR의 첫번째 변성 단계에서 비활성화되고 증폭 반응에는 영향을 미치지 않는다.

●신장성·증폭 효율 향상 반응 버퍼 조성을 지적화함으로써, 종래의 KOD DNA Polymerase보다 신장성·증폭 효율이 향상하고 있습니다.

● 우수한 내열성
Taq DNA polymerase보다 내열성이 우수하므로 변성 단계의 온도를 높게 설정할 수 있으며 GC가 풍부한 고차 구조를 형성하는 타겟에 효과적입니다.

● 높은 PCR 성공률 「KOD -Plus-Ver.2」[Code No. KOD-211]
증폭하기 어려운 타겟이나 긴 타겟에 대한 PCR 성공률이 KOD -Plus-보다 향상되었습니다. 또, 역전사 반응액의 반입에 의한 저해도 저감되고 있습니다.

원리

실시예

1. GC 리치 타겟의 증폭 비교

GC 함량 약 70%의 Pseudomonas의 리파아제 유전자를 포함하는 플라스미드를 주형에 약 2kb를 타겟으로 하여 PCR을 실시하고, rTaq DNA Polymerase와 증폭도의 비교를 실시했습니다. 사이클은 연장 온도를 제외하고는 동일한 조건에서 수행되었다. 그 결과, KOD-Plus-에서는 통상의 조건에서 강한 증폭을 확인할 수 있었지만, rTaq DNA Polymerase에서는 5% DMSO 또는 A사 PCR 인핸서를 첨가한 조건에서만 증폭을 확인할 수 있다. 네.

2. 타사 고정확성 PCR 효소와의 PCR 증폭 성능 비교

Human β-globin 유전자 0.6~3.6kb를 타겟으로 하여 KOD-Plus- 및 타사 고정확성 PCR 효소를 이용하여 증폭하여 비교를 실시했습니다. 그 결과, KOD-Plus-는 타사 High Fidelity 효소에 비해 양호한 증폭을 나타냈다.

3. 각종 cDNA를 타깃으로 한 타사 PCR용 효소와의 증폭 성능의 비교

HeLa total RNA로부터 역전사한 cDNA를 주형으로 하여, 4종류의 타겟에 대해 PCR 효율의 비교를 실시했습니다.
그 결과, KOD-Plus-Ver.2는 다른 효소에 비해 양호한 증폭을 보였다. 특히 증폭이 어려운 6.8kb의 타겟에서도 명확한 증폭이 보였습니다.


실시예 4: inverse PCR에 의한 부위 특이적 변이 도입
실시예 5: 다양한 주형을 이용한 Long PCR
실시 예 6 : Colony direct-PCR에 의한 스타필로코커스 아우레우스의 유전자 프로파일 분석
실시예 7: Colony direct-PCR에 의한 각종 미생물 유전자의 간편·신속 검출
실시 예 8 : 헤파린 함유 샘플을 사용한 PCR에서 베타 인 첨가 효과

기타 실시예

참고 문헌

1) J. Mo et al., J. Mol. Biol ., 222 : 925-936(1991)
2) M. Takagi et al., Appl. Environ. Microbiol. , 63 : 4504-4510(1997)
3) H. Hashimoto et al., J. Biochem. (Tokyo), 125 : 983-986 (1999)
4) H. Mizuguchi et al., J. Biochem. (Tokyo), 126 : 762-768 (1999)
5) H. Hashimoto et al., J. Mol. Biol. , 306 : 469-477(2001)
6) M. Watanabe et al., J. Biochem . (Tokyo), 131 : 183-191 (2002)
7) H. Terasaki et al., Intl. J. Mol. Med. , 9: 107-112(2002)


제품 내용

【KOD-201】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-2B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개

【KOD-211】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-3B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개

*KOD 항체를 1.6μg/μL의 농도로 포함하고 있습니다.

모양:
50mM Tris-HCl(pH8.0)
0.1mM EDTA
1mM DTT 0.001% Tween ® 20
0.001% Nonidet ® P-40
50% Glycerol

활동 정의 :
75℃에 있어서, 30분간에 10nmol의 전체 뉴클레오티드를 산 불용성 분획에 도입하는 효소량을 1U로 합니다.

순도 본 효소 15U와 pBR322 1㎍을 75℃에서 4시간 반응시켜도 전기영동 패턴은 변화하지 않는 것을 확인하고 있습니다.

기원:
E.coli 재조합체

주의사항

PCR에는 제품에 첨부되어 있는 dNTPs 또는 별매의 dNTPs Mixture (2mM) [NTP-201]을 사용해 주십시오. 다른 dNTPs에서는 충분한 성능을 얻지 못할 수 있습니다.

기본 반응 조건


10×PCR Buffer(KOD -Plus-용) 5μL
25mM MgSO 4 2μL (1mM)
각 Primer 15pmol each 2mM
dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genomic DNA)
~1μL(역전사 반응액)*
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL
※원포인트 어드바이스의 RT 반응액을 샘플로 하는 경우, 를 확인해 주십시오.

<3단계 사이클> *
94℃, 2min.

94℃, 15sec.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles

<2단계 사이클> *
94℃, 2min.

94℃, 15sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles


10×PCR Buffer(KOD -Plus- Ver.2용) 5μL
25mM MgSO 4 3μL (1.5mM)
각 Primer 15pmol each
2mM dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genome DNA)
~2μL(역전사 반응액)
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL

<3단계 사이클> *
94℃, 2min.

98 ℃, 10 초.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles

<2단계 사이클> *
94℃, 2min.

98 ℃, 10 초.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles

* 일반적으로 3단계 사이클을 수행합니다.
Tm값이 72℃ 이상의 프라이머를 이용하여 3스텝 사이클에서 스미어가 인정된 경우, 2스텝 사이클을 하면 스미어가 해소되는 경우가 있습니다.

프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다.

비고

※10×PCR Buffer는 본 효소 전용입니다. KOD DNA Polymerase의 Buffer와는 조성이 다릅니다.

원포인트 조언

●PCR 산물의 클로닝 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있어, 평활 말단 클로닝법에 의해 클로닝할 수 있습니다.
그 때 벡터측을 탈인산화 처리하고 있는 경우, PCR 산물의 인산화를 실시하거나, 5'인산기가 붙은 프라이머를 사용할 필요가 있습니다.
또한, 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있기 때문에 직접 TA 클로닝할 수 없습니다. 전용 TA 클로닝 키트 "TArget Clone TM -Plus-"를 사용하십시오.

● PCR 조건의 설정에 대해서 효소의 표준 사용량은 50μL의 계에 대해 1U로 해 주십시오. 신장 반응은 68℃에서 실시하고 타겟 1kb에 대해 1min.을 표준으로 합니다.
스메어링이 일어나고 있는 경우는 MgSO 4 의 농도를 낮추고, 증폭이 보이지 않는 경우는 MgSO 4 농도를 올려 검토한다.

●GC 리치인 주형의 경우 반응액에 DMSO를 최종 농도 2~5% 정도 첨가함으로써 개선되는 경우가 있습니다.

●RT 반응액을 주형으로 하는 경우
RT 반응액의 대량의 반입은 본 효소에 의한 PCR 반응을 저해하는 경우가 있습니다. RT반응액의 PCR로의 반입은 PCR반응액의 1/25이하(바람직하게는 1/50이하)를 추천합니다. 이 경우, RT 반응액으로부터의 Mg2+나 dNTPs의 반입에 대해서는 고려할 필요는 없고, 기본 반응 조건에 따라, 본 효소의 첨부의 dNTPs와 MgSO4를 첨가해 주시면 문제 없습니다.

●프라이머의 설계 3'측에 미스매치가 있는 프라이머는, 본 효소에 의해 교정을 받는 경우가 있습니다.

프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다. 이노신을 포함하는 프라이머의 Tm 값은 이 방법으로 계산할 수 없습니다.

●DNA 말단 평활화에 이용하는 경우는 이쪽을 봐 주세요.

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dATP, dGTP, dCTP, dTTP 혼합 용액

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PCR 산물 TA 클로닝 키트 (평활 말단용)

품명 Code No. 포장 저장 온도 설명서 사양 SDS 법규제
품명 TArget Clone -Plus- Code No.TAK-201 포장 10회용 저장 온도 설명서 사양 SDS 법규제 -20℃

평활 말단 PCR 산물에 dA 첨가

품명 Code No. 포장 저장 온도 설명서 사양 SDS 법규제
품명 10×A-attachment Mix Code No.TAK-301 포장 25μL(25회용) 저장 온도 설명서 사양 SDS 법규제 -20℃

제품 내용

【KOD-201】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-2B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개

【KOD-211】
KOD -Plus-(1U/μL) * 200μL×1개
10×PCR Buffer [KOD-3B] 1mL×1개
25mM MgSO 4 [KOD-2S] 1mL×1개
2mM dNTPs [NTP-201] 1mL×1개

*KOD 항체를 1.6μg/μL의 농도로 포함하고 있습니다.

모양:
50mM Tris-HCl(pH8.0)
0.1mM EDTA
1mM DTT 0.001% Tween ® 20
0.001% Nonidet ® P-40
50% Glycerol

활동 정의 :
75℃에 있어서, 30분간에 10nmol의 전체 뉴클레오티드를 산 불용성 분획에 도입하는 효소량을 1U로 합니다.

순도 본 효소 15U와 pBR322 1㎍을 75℃에서 4시간 반응시켜도 전기영동 패턴은 변화하지 않는 것을 확인하고 있습니다.

기원:
E.coli 재조합체

주의사항

PCR에는 제품에 첨부되어 있는 dNTPs 또는 별매의 dNTPs Mixture (2mM) [NTP-201]을 사용해 주십시오. 다른 dNTPs에서는 충분한 성능을 얻지 못할 수 있습니다.

기본 반응 조건


10×PCR Buffer(KOD -Plus-용) 5μL
25mM MgSO 4 2μL (1mM)
각 Primer 15pmol each 2mM
dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genomic DNA)
~1μL(역전사 반응액)*
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL
※원포인트 어드바이스의 RT 반응액을 샘플로 하는 경우, 를 확인해 주십시오.

<3단계 사이클> *
94℃, 2min.

94℃, 15sec.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles

<2단계 사이클> *
94℃, 2min.

94℃, 15sec.
68℃, 1min./kb 25~35 cycles


10×PCR Buffer(KOD -Plus- Ver.2용) 5μL
25mM MgSO 4 3μL (1.5mM)
각 Primer 15pmol each
2mM dNTPs 5μL(0.2mM)
주형 1~50ng(Plasmid)
10~200ng(Genome DNA)
~2μL(역전사 반응액)
KOD -Plus-(1U/μL) 1μL(1U)
Total Volume 50μL

<3단계 사이클> *
94℃, 2min.

98 ℃, 10 초.
Tm-5℃, 30sec.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles

<2단계 사이클> *
94℃, 2min.

98 ℃, 10 초.
68℃, 1min./kb 25~40 cycles

* 일반적으로 3단계 사이클을 수행합니다.
Tm값이 72℃ 이상의 프라이머를 이용하여 3스텝 사이클에서 스미어가 인정된 경우, 2스텝 사이클을 하면 스미어가 해소되는 경우가 있습니다.

프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다.

비고

※10×PCR Buffer는 본 효소 전용입니다. KOD DNA Polymerase의 Buffer와는 조성이 다릅니다.

원포인트 조언

●PCR 산물의 클로닝 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있어, 평활 말단 클로닝법에 의해 클로닝할 수 있습니다.
그 때 벡터측을 탈인산화 처리하고 있는 경우, PCR 산물의 인산화를 실시하거나, 5'인산기가 붙은 프라이머를 사용할 필요가 있습니다.
또한, 본 효소의 PCR 산물은 평활화되어 있기 때문에 직접 TA 클로닝할 수 없습니다. 전용 TA 클로닝 키트 "TArget Clone TM -Plus-"를 사용하십시오.

● PCR 조건의 설정에 대해서 효소의 표준 사용량은 50μL의 계에 대해 1U로 해 주십시오. 신장 반응은 68℃에서 실시하고 타겟 1kb에 대해 1min.을 표준으로 합니다.
스메어링이 일어나고 있는 경우는 MgSO 4 의 농도를 낮추고, 증폭이 보이지 않는 경우는 MgSO 4 농도를 올려 검토한다.

●GC 리치인 주형의 경우 반응액에 DMSO를 최종 농도 2~5% 정도 첨가함으로써 개선되는 경우가 있습니다.

●RT 반응액을 주형으로 하는 경우
RT 반응액의 대량의 반입은 본 효소에 의한 PCR 반응을 저해하는 경우가 있습니다. RT반응액의 PCR로의 반입은 PCR반응액의 1/25이하(바람직하게는 1/50이하)를 추천합니다. 이 경우, RT 반응액으로부터의 Mg2+나 dNTPs의 반입에 대해서는 고려할 필요는 없고, 기본 반응 조건에 따라, 본 효소의 첨부의 dNTPs와 MgSO4를 첨가해 주시면 문제 없습니다.

●프라이머의 설계 3'측에 미스매치가 있는 프라이머는, 본 효소에 의해 교정을 받는 경우가 있습니다.

프라이머의 Tm값의 계산은 최근 접염기 대법(Nearest Neighbor method)을 이용하고 있습니다. 프라이머의 Tm값 계산표(EXCEL)는, 이쪽 으로부터 다운로드 받을 수 있습니다. 이노신을 포함하는 프라이머의 Tm 값은 이 방법으로 계산할 수 없습니다.

●DNA 말단 평활화에 이용하는 경우는 이쪽을 봐 주세요.

※ 법규제에 대해서

독물 및 극물 단속법 [의약용 외독물]

독물 및 극물 단속법 [의약용 외극물]

위험소방법[위험물]

구입시에 신청서의 제출이 필요한 제품

없음상기 법령이나 신청서의 제출에 해당하지 않는 제품

국가국민보호법[독소]

세트카르타헤나 법 (유전자 재조합 생물 등의 사용 등의 규제에 의한
생물의 다양성 확보에 관한 법률)

PPRTR법(화학물질 배출 파악 관리 촉진법) [신고 의무 물질]

노동노동안전보건법[통지 또는 표시의무물질]